A Igreja Matriz de Trofa está encerrada ao público desde Agosto de 2006, para obras de conservação, restauro e valorização Estão paradas e devem ser retomadas por estes dias e concluídas até Abril de 2008.
Foram detectadas “anomalias graves na abóbada da Capela Mor, que indicavam instabilidade estrutural e possível risco de colapso”. Anomalias que, ainda segundo o IPPAR, só se tornaram visíveis após a remoção das telhas, picagem de rebocos e levantamento da cobertura. Foi este o motivo principal para a suspensão das obras, pois, segundo os técnicos do IPPAR, para a resolução do problema “seriam necessários novos estudos e novas soluções”.
O serviços litúrgicos,enquanto as obras de restauro estão a decorrer, realizam-se numa sala do Centro Pastoral de Trofa. Este facto, aliado aos inúmeros visitantes que todos os fins-de-semana (e não só!) passam pela Igreja Matriz da Trofa, para visitar o monumento histórico, redobram, segindo a Câmara Municipal de Águeda, “o interesse e a necessidade da conclusão desta empreitada”.